序号 | 数据库名称 | 数据库类型 | 网址 |
1 | Arabidopsis Co-expression Tool | 模块化调控网络 | http://act.yeastgenome.org/ |
2 | ATTED-II | 基因共表达网络 | https://atted.jp/ |
3 | BarleyNet | 大麦基因调控网络 | http://barleynet.info/ |
4 | CISTROME | 转录因子结合位点 | http://cistrome.org/db/#/ |
5 | CRESS | 能量诱导热休克网络 | http://cress.salk.edu/ |
6 | DEGseq | 差异表达基因 | http://bioinfo.cau.edu.cn/degseq/ |
7 | EpiFactors | 表观基因调控网络 | http://epifactors.autosome.ru/index.html |
8 | Epigenome Network | 表观遗传基因调控网络 | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/epigenomics/reports/ |
9 | FANTOM5 | 非编码RNA数据库 | http://fantom.gsc.riken.jp/5/ |
10 | FunCoup 3.0 | 转录因子、蛋白质互作网络 | http://funcoup3.lumc.edu/ |
11 | GeneMANIA | 基因和功能预测 | http://genemania.org/ |
12 | GTRD | 转录调控因子数据库 | http://gtrd.biouml.org |
13 | iRegulon | 转录调控因子靶基因网络 | http://iregulon.aertslab.org/ |
14 | JASPAR | 转录因子结合位点 | http://jaspar2018.genereg.net/index.php |
15 | maize eFP Browser | 玉米表达数据 | https://bar.utoronto.ca/efp_maize/cgi-bin/efpWeb.cgi |
16 | Maize Genetics and Genomics | 玉米基因调控网络 | https://www.maizegdb.org/ |
17 | NetProphet | 蛋白质相互作用网络 | http://netprophet.org/about.html |
18 | PlantCARE | 植物转录调控元件搜集 | http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/ |
19 | PlantMetabolomics.net | 植物代谢组学 | http://www.plantmetabolomics.net/ |
20 | PlantRegMap | 拟南芥基因调控网络 | http://plantregmap.cbi.pku.edu.cn/ |
21 | REDfly | 转录调控因子与启动子 | http://redfly.ccr.buffalo.edu/index.php |
22 | RegNetwork | 基因调控网络 | http://www.regnetworkweb.org/ |
23 | SWISS-MODEL Repository | 蛋白质结构预测和修正 | https://swissmodel.expasy.org/repository |
24 | TcoF-DB | 细胞周期基因调控 | http://genome.jouy.inra.fr/tcof-db |
25 | TRED | 转录调控因子数据库 | http://cbrc.kaust.edu.sa/tred/ |
26 | WikiPathways | 生物通路数据 | https://www.wikipathways.org/portal/search/ |
27 | YeastMine | 酵母基因功能分析 | http://yeastmine.yeastgenome.org:8080/yeastmine/ |
28 | YPA | 酵母转录组分析 | https://ypa.ee.ncku.edu.tw/index.php |
29 | ZFIN | 斑马鱼遗传资源库 | https://zfin.org/ |
30 | ZRT1 | 酿酒酵母锌离子转运蛋白 | http://www.sb.cs.miyazaki-u.ac.jp/~biolinfo/zrt1db/ |