| 序号 No. | 种Species | 分类地位Fauna | 保护级别 Protection level | ||
| 纲Class | 目Order | 科Family | |||
| 1 | 秦岭细鳞鲑Brachymytax lenok tsinlingensis | 硬骨鱼纲 | 鲑形目 | 鲑科 | 二级 |
| 2 | 岷县高原鳅Triplophysa minxianensis |
| 鲤形目 | 鳅科 | 省级 |
| 3 | 秦巴巴鲵Liua tsinpaensis | 两栖纲 | 有尾目 | 小鲵科 | 二级 |
| 4 | 大鲵Andrias davidianus |
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| 隐鳃鲵科 | 二级 |
| 5 | 宁陕齿突蟾Scutiger ningshanensis |
| 无尾目 | 角蟾科 | 二级 |
| 6 | 齿蟾Oreolalax sp. |
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| 省级 |
| 7 | 秦岭雨蛙Hyla tsinlingensis |
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| 雨蛙科 | 省级 |
| 8 | 中国林蛙Rana chensinensis |
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| 蛙科 | 省级 |
| 9 | 隆肛蛙Feirana quadranus |
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| 叉舌蛙科 | 省级 |
| 10 | 秦岭滑蜥Scincella tsinlingensis | 爬行纲 | 有鳞目 | 石龙子科 | 省级 |
| 11 | 极北蝰Vipera berus |
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| 蝰科 | 二级 |
| 12 | 白头蝰Azemiops feae |
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| 省级 |
| 13 | 秦岭蝮Gloydius qinlingensis |
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| 省级 |
| 14 | 宁陕线形蛇Stichophanes ningshaanensis |
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| 游蛇科 | 省级 |
| 15 | 乌梢蛇Ptyas dhumnades |
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| 省级 |
| 16 | 玉斑蛇Euprepiophis mandarinus |
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| 省级 |
| 17 | 黑眉晨蛇Orthriophis taeniura |
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| 省级 |
| 18 | 王锦蛇Elaphe carinata |
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| 省级 |
| 19 | 乌华游蛇Sinonatrix percarinata |
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| 省级 |
| 20 | 黑鹳Ciconia nigra | 鸟纲 | 鹳形目 | 鹳科 | 一级 |
| 21 | 松雀鹰Accipiter virgatus |
| 鹰形目 | 鹰科 | 二级 |
| 22 | 赤腹鹰Accipiter soloensis |
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| 二级 |
| 23 | 黑耳鸢Milvus korschun |
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| 二级 |
| 24 | 金雕Aquila chrysaetos |
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| 一级 |
| 25 | 红隼Falco tinnunculus |
| 隼形目 | 隼科 | 二级 |
| 26 | 燕隼Falco subbuteo |
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| 二级 |
| 27 | 西红脚隼Falco vespertinus |
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| 二级 |
| 28 | 血雉Ithaginis cruentus |
| 鸡形目 | 雉科 | 二级 |
| 29 | 红腹角雉Tragopan temminckii |
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| 二级 |
| 30 | 勺鸡Pucrasia macrolopha |
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| 二级 |
| 31 | 红腹锦鸡Chrysolophus pictus |
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| 二级 |
| 32 | 白冠长尾雉Syrmaticus reevesii |
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| 一级 |
| 33 | 灰林鸮Strix aluco |
| 鸮形目 | 鸱鸮科 | 二级 |
| 34 | 雕鸮Bubo bubo |
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| 二级 |
| 35 | 领角鸮Otus lettia |
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| 二级 |
| 36 | 西红角鸮Otus scops |
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| 二级 |
| 37 | 斑头鸺鹠Glaucidium cuculoides |
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| 二级 |
| 38 | 长耳鸮Asio otus |
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| 二级 |
| 39 | 三宝鸟Eurystomus orientalis |
| 佛法僧目 | 佛法僧科 | 省级 |
| 40 | 红胁绣眼鸟Zosterops erythropleurus |
| 雀形目 | 绣眼鸟科 | 二级 |
| 41 | 红腹山雀Poecile davidi |
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| 山雀科 | 二级 |
| 42 | 三趾鸦雀Cholornis paradoxus |
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| 莺鹛科 | 二级 |
| 43 | 蓝鹀Emberiza siemsseni |
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| 鹀科 | 二级 |
| 44 | 黄喉鹀Emberiza elegans |
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| 省级 |
| 45 | 寿带Terpsiphone incei |
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| 王鶲科 | 省级 |
| 46 | 画眉Garrulax canorus |
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| 噪鹛科 | 二级 |
| 47 | 斑背噪鹛Garrulax lunulatus |
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| 二级 |
| 48 | 橙翅噪鹛Trochalopteron elliotii |
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| 二级 |
| 49 | 红嘴相思鸟Leiothrix lutea |
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| 二级 |
| 50 | 灰头灰雀Pyrrhula erythaca |
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| 燕雀科 | 省级 |
| 51 | 酒红朱雀Carpodacus vinaceus |
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| 省级 |
| 52 | 狼Canis lupus | 哺乳纲 | 食肉目 | 犬科 | 二级 |
| 53 | 赤狐Vulpes vulpes |
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| 二级 |
| 54 | 豺Cuon alpinus |
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| 一级 |
| 55 | 黑熊Ursus thibetanus |
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| 熊科 | 二级 |
| 56 | 黄喉貂Martes flavigula |
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| 鼬科 | 二级 |
| 57 | 水獭Lutra lutra |
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| 二级 |
| 58 | 猪獾Arctonyx collaris |
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| 省级 |
| 59 | 亚洲狗獾Meles leucurus |
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| 省级 |
| 60 | 大灵猫Viverra zibetha |
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| 灵猫科 | 一级 |
| 61 | 花面狸Paguma larvata |
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| 省级 |
| 62 | 豹猫Prionailurus bengalensis |
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| 猫科 | 二级 |
| 63 | 金猫Pardofelis temminckii |
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| 一级 |
| 64 | 豹Panthera pardus |
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| 一级 |
| 65 | 毛冠鹿Elaphodus cephalophus |
| 偶蹄目 | 鹿科 | 二级 |
| 66 | 狍Capreolus pygargus |
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| 省级 |
| 67 | 小麂Muntiacus reevesi |
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| 省级 |
| 68 | 林麝Moschus berezovskii |
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| 麝科 | 一级 |
| 69 | 秦岭羚牛Budorcas bedfordi |
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| 牛科 | 一级 |
| 70 | 中华鬣羚Capricornis milneedwardsii |
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| 二级 |
| 71 | 长尾斑羚Naemorhedus caudatus |
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| 二级 |
| 72 | 红白鼯鼠Petaurista alborufus |
| 啮齿目 | 鼯鼠科 | 省级 |
| 73 | 复齿鼯鼠Trogopterus xanthipes |
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| 省级 |
| 74 | 金裳凤蝶Troides aeacus | 昆虫纲 | 鳞翅目 | 凤蝶科 | 二级 |