| 扩增基因 | 国家/地区/机构 | 引物序号 | 引物序列 | 基因组区域 | |
| ORF1ab (1-21290) | 中国 | ① | F | 5’-CCCTGTGGGTTTTACACTTAA-3’ | 13342-13362 (NSP10) |
| R | 5’-TCAGCTGATGCACAATCGT-3’ | 13442-13460 (RdRp) | |||
| WHO | ② | F | 5’-GTGAAATGGTCATGTGTGGCGG-3’ | 15431-15452 (RdRp) | |
| R | 5’-TATGCTAATAGTGTTTTTAACATTTG-3’ | 15505-15530 (RdRp) | |||
| 中国香港 | ③ | F | 5’-TGGGGYTTTACRGGTAACCT-3’ | 18778-18797 (NSP14) | |
| R | 5’-AACRCGCTTAACAAAGCACTC-3’ | 18889-18909 (NSP14) | |||
| N (28274-29533) | 中国 | ④ | F | 5’-GGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT-3’ | 28881-28902 |
| R | 5’-CAGCTTGAGAGCAAAATGTCTG-3’ | 28958-28979 | |||
| 中国香港 | ⑤ | F | 5’-TAATCAGACAAGGAACTGATTA-3’ | 29145-29166 | |
| R | 5’-CGAAGGTGTGACTTCCATG-3’ | 29236-29254 | |||
| 美国 | ⑥ | F | 5’-GACCCCAAAATCAGCGAAAT-3’ | 28287-28306 | |
| R | 5’-TCTGGTTACTGCCAGTTGAATCTG-3’ | 28335-28358 | |||
| ⑦ | F | 5’-TTACAAACATTGGCCGCAAA-3’ | 29164-29183 | ||
| R | 5’-GCGCGACATTCCGAAGAA-3’ | 29213-29230 | |||
| ⑧
| F | 5’-GGGAGCCTTGAATACACCAAAA-3’ | 28681-28702 | ||
| R | 5’-TGTAGCACGATTGCAGCATTG-3’ | 28732-28752 | |||
| 日本 | ⑨ | F | 5’-AAATTTTGGGGACCAGGAAC-3’ | 29125-29144 | |
| R | 5’-TGGCAGCTGTGTAGGTCAAC-3’ | 29280-29299 | |||
| E (26245-26472) | WHO | ⑩ | F | 5’-ACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGT-3’ | 26269-26294 |
| R | 5’-TGTGTGCGTACTGCTGCAATAT-3’ | 26360-26381 | |||
| 德国 | ⑪ | F | 5’-ACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGT-3’ | 26269-26294 | |
| R | 5’-ATATTGCAGCAGTACGCACACA-3’ | 26360-26381 | |||