| 数据库 | 类型 | 物种 | 数据集量(个) | 组织种类(种) | 细胞量(个) | 细胞种类(种) |
| SCovid | COVID-19疾病 | 人类 | 21 | 10 | 1,042,227 | / |
| CancerSEA | 25种癌症 | 人类 | 49 | / | 41,900 | / |
| SC2disease | 25种疾病 | 人类 | / | 29 | / | 341 |
| CellMarker2.0 | 标记基因 | 人类、小鼠 | / | 656 | / | 2578 |
| Expression Atlas [25] | 综合 | 人类、小鼠等 18个物种 | / | / | 590万 | / |
| HCA | 综合 | 人类 | 200 | 80 | 1990万 | 200 |
| CancerSCEM [26] | 20种人类癌症 | 人类 | 208 | / | / | / |
| Cellatlas [27] | 综合 | 小鼠等15个物种 | / | / | 260万 | / |
| HTCA [28] | 综合 | 人类 | 3000 | / | 230万 | / |
| HUSCH [29] | 综合 | 人类 | 185 | 45 | 300万 | 270 |
| ABC portal [30] | 血液/免疫系统 | 人类、小鼠 | 198 | / | / | / |
| MCA [31] | 综合 | 小鼠 | / | 56 | / | 160 |
| Tabula Muris [32] | 综合 | 小鼠 | / | 20 | 10万 | / |
| Allen Cell Types Database [33] |
| 人类、小鼠 | / | / | 27,000 | 60 |
| The Human BioMolecular Atlas Program (HuBMAP) [34] | 综合 | 人类 | 1480 | 31 | / | / |
| Tabula Muris Senis [35] | 综合 | 老年小鼠 | / | 21 | 151,882 | 60 |
| PanglaoDB | 综合 | 人类、小鼠 | / | 258 | 559万 | / |
| scRNASeqDB [36] | 综合 | 人类 | 200 | / | / | 8,910 |
| CellBlast | 综合 | 人类、小鼠、 斑马鱼等 | 168 | / | / | / |