软件名称 | 网址 | 用途 |
BLAST | https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome | 序列同源性比对 |
PROMO | http://alggen.lsi.upc.es/cgi-bin/promo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.3 | 转录顺式作 用元件预测 |
FPROM | http://www.softberry.com/berry.phtml?topic=fprom&group=programs&subgroup=promoter | 转录顺式作 用元件预测 |
NNPP | http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html | 核心启动子区域预测 |
Promoter Scan | https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/ | 启动子预测 |
MethPrimer | http://www.urogene.org/cgi-bin/methprimer2/MethPrimer.cgi | CpG岛预测 |
Methylation Primer Express v1.0 | / | 甲基化引物设计 |
Primer Preimer 5.0 | / | 引物设计 |
Phylogeny | / | 进化树构建 |