软件名称

网址

用途

BLAST

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome

序列同源性比对

PROMO

http://alggen.lsi.upc.es/cgi-bin/promo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.3

转录顺式作 用元件预测

FPROM

http://www.softberry.com/berry.phtml?topic=fprom&group=programs&subgroup=promoter

转录顺式作 用元件预测

NNPP

http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html

核心启动子区域预测

Promoter Scan

https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/

启动子预测

MethPrimer

http://www.urogene.org/cgi-bin/methprimer2/MethPrimer.cgi

CpG岛预测

Methylation Primer Express v1.0

/

甲基化引物设计

Primer Preimer 5.0

/

引物设计

Phylogeny

/

进化树构建