相互作用形式

类型

表达式

参数

成键相互作用

L-J势

$U_{LJ}\left(r\right)=4{\epsilon }_{ij}\left[{\left(\frac{{\sigma }_{ij}}{r}\right)}^{12}-{\left(\frac{{\sigma }_{ij}}{r}\right)}^6\right]$

${\sigma }_{ij}=0.47\text{nm}$

库仑能

$U_{el}\left(r\right)=\frac{q_i{q}_j}{4\pi {\epsilon }_0{\epsilon }_{r}r}$

${\epsilon }_r=15$

非键相互作用

键能

$V_b=\frac{1}{2}{K}_b{\left(d_{ij}-d_b\right)}^2$

$K_{\text{bond}}=1250\text{KJ}{\text{mol}}^{-1}{\text{nm}}^{-2}$

$K_{\text{bond}}=0.47\text{nm}$

键角能

$V_a=\frac{1}{2}{K}_a{\left[\cos \left({\theta }_{ijk}\right)-\cos \left({\theta }_a\right)\right]}^2$

$K_{\text{angle}}\text{=25}\text{KJ}{\text{mol}}^{-1}{\text{rad}}^{-2}$

${\theta }_{\text{0}}={180}^{\circ }$

二面角能

$V_d=K_d\left[1+\cos \left(n{\phi }_{ijkl}-{\phi }_d\right)\right]$