类型Category

属性Property

No. of all scaffolds

组装后得到的基因组片段，完成图组装结果为全基因组，所以数目为1，扫描图组装到 scaffold水平，此数目即为scaffold数目

Bases in all scaffolds

组装用列的总长，完成图即为基因组大小，扫描图为所有scaffold全长

No. of large scaffbrds (>1000 bp)

长度 > 1000 bp的scaffold的数目

Bases in large scaffolds

长度 > 1000 bp的所有scaffold的全长

Largest length

最长的scaffold的长度

Scaffold N50

见注释

Scaffold N90

见注释

G + C content

组装序列中的GC含量

N rate

组装序列中未知碱基的占比，reads组装到contig，contig再连接形成scaffold，contig和 contig在连接中可能存在未知碱基

Bases in all contigs

所有contig的全长

No. of large contigs (>1000 bp)

长度 > 1000 bp的contig的数目

Bases in large contigs

长度 > 1000 bp的所有contig的全长

Largest length

最长的contig的长度

Contig N50

见注释

Contig N90

见注释