算法

表征方式

相似度/不相似度计算

RDF

径向分布信息：

$RD{F}_{k,s1,s2}\left(R_n\right)$

点积：

${\displaystyle \sum }_n^{N_{bin}}{\displaystyle \sum }_{s1}^{N_{spc}}{\displaystyle \sum }_{s2}^{N_{spc}}\frac{RD{F}_{1,s1,s2}\left(R_n\right)RD{F}_{2,s1,s2}\left(R_n\right)}{n_1{n}_2}$

BCM

键表征矩阵：

$Q_l^{{\delta }_{AB}}$

欧氏距离：

${\left[{\displaystyle \sum }_{{\delta }_{AB}}{\displaystyle \sum }_l{\left(Q_l^{{\delta }_{AB},u}-Q_l^{{\delta }_{AB},v}\right)}^2\right]}^{\frac{1}{2}}$

GT

拓扑信息：

$G{T}_A\left(R_n\right)$

异或操作：

$G{T}_A\left(R_n\right)\oplus G{T}_B\left(R_n\right)$

VDW

VDW势信息：

$U_k\left(F_n\right)$

加权余弦距离：

${\displaystyle \sum }_N\frac{1}{2}{w}_{a{a}^{\prime }}\left(1-\frac{{{\displaystyle \sum }}_N{F}_a\left(n\right)\ast F_{a^{\prime }}\left(n\right)}{\sqrt{{{\displaystyle \sum }}_N{F}_a^2\left(n\right)}\sqrt{{{\displaystyle \sum }}_N{F}_{a^{\prime }}^2\left(n\right)}}\right)$