| 类型 | 名称 | 序列 | 数量 | 物种 |
| 启动子和增强子区域中常见的顺式作用元件 | CAAT-box | CCAAT | 3 | 拟南芥 |
| CAAAT | 1 | 拟南芥 | ||
| 与分生组织表达相关的顺式调控元件 | CAT-box | GCCACT | 3 | 拟南芥 |
| 参与昼夜节律调控的顺式调控元素 | circadian | CAAAGATATC | 1 | 番茄 |
| G-box | CACGAC | 1 | 玉米 | |
| 光响应元件的一部分 | GTGGC-motif | TCTTAC | 2 | 拟南芥 |
| 参与干旱诱导的MYB结合位点 | MBS | CAACTG | 1 | 拟南芥 |
| 赤霉素响应元件 | P-box | CCTTTTG | 1 | 水稻 |
| 转录起始点周围的核心启动子元件(位于−30位置附近) | TATA-box | TATA | 1 | 拟南芥 |
| 参与防御和应激响应的顺式调控元素 | TC-rich repeats | GTTTTCTTAC | 1 | 烟草 |
| 短函数 | \ | motif_sequence | 15 | 任何生物体或有机体 |