| 时间 | 优势种 | 优势度 | |
| 2015年夏季 | 马氏平裂藻 | Merismopedia marssonii | 0.087 | 
| 短线脆杆藻 | Fragilaria brevistriata | 0.085 | |
| 钝脆杆藻 | Fragilaria capucina | 0.072 | |
| 棕鞭藻属一种 | Ochromonas sp. | 0.068 | |
| 尖针杆藻 | Synedra acus | 0.057 | |
| 狭形纤维藻 | Ankistrodesmus angustus | 0.050 | |
| 四角十字藻 | Crucigenia quadrata | 0.048 | |
| 四足十字藻 | Crucigenia tetrapedia | 0.045 | |
| 固氮鱼腥藻 | Anabaena azotica | 0.040 | |
| 阿氏席藻 | Phormidium allorgei | 0.034 | |
| 华美色金藻 | Chromulina elegans | 0.029 | |
| 纤细角星鼓藻 | Staurastrum gracile | 0.029 | |
| 卵形衣藻 | Chlamydomonas ovalis | 0.024 | |
| 球衣藻 | Chlamydomonas globosa | 0.024 | |
| 极小集胞藻 | Synechocystis minuscula | 0.024 | |
| 实球藻 | Pandorina morum | 0.021 | |
| 2015年秋季 | 阿氏席藻 | Phormidium allorgei | 0.092 | 
| 固氮鱼腥藻 | Anabaena azotica | 0.077 | |
| 球衣藻 | Chlamydomonas globosa | 0.072 | |
| 钝脆杆藻 | Fragilaria capucina | 0.062 | |
| 极小集胞藻 | Synechocystis minuscula | 0.046 | |
| 棕鞭藻属一种 | Ochromonas sp. | 0.046 | |
| 小三毛金藻 | Prymnesium parvum | 0.040 | |
| 狭形纤维藻 | Ankistrodesmus angustus | 0.031 | |
| 尖针杆藻 | Synedra acus | 0.028 | |
| 
 | 鱼鳞藻属一种 | Mallomonas sp. | 0.027 | 
| 分歧锥囊藻 | Dinobryon divergens | 0.027 | |
| 空球藻 | Eudorima elegans | 0.024 | |
| 短线脆杆藻 | Fragilaria brevistriata | 0.020 | |
| 多棘栅藻 | Scenedesmus spinosus | 0.020 | |
| 梅尼小环藻 | Cyclotella meneghiniana | 0.020 | |
| 2020年夏季 | 中华小尖头藻 | Raphidiopsis sinensia | 0.359 | 
| 水华束丝藻 | Aphanizomenon flos-aquae | 0.178 | |
| 伪鱼腥藻 | Pseudoanabaena schmidlei | 0.055 | |
| 肘状针杆藻 | Synedra ulna | 0.049 | |
| 卷曲纤维藻 | Ankistrodesmus convolutus | 0.047 | |
| 尖针杆藻 | Synedra acus | 0.041 | |
| 肘状针杆藻狭细变种 | Synedra ulna var.danica | 0.021 | |
| 微小平裂藻 | Oscillatoria tenuissima | 0.021 | |
| 2020年秋季 | 水华束丝藻 | Aphanizomenon flos-aquae | 0.319 | 
| 钝顶螺旋藻 | Spirulina platensis | 0.133 | |
| 中华小尖头藻 | Raphidiopsis sinensia | 0.115 | |
| 尖针杆藻 | Synedra acus | 0.044 | |
| 肘状针杆藻狭细变种 | Synedra ulna var.danica | 0.034 | |
| 肘状针杆藻 | Synedra ulna | 0.028 | |
| 伪鱼腥藻 | Pseudoanabaena schmidlei | 0.021 | |